Неправильно описывал проблему. Надо было так:
В режиме отопления котел мог остановиться, то есть погаснуть горелка и остановиться насос. В это время светился только оранжевый светодиод несколько секунд. Потом он начинал мигать, включался насос и горелка пыталась загореться. Иногда загоралась сразу, а чаще с нескольких попыток. И вот если в это время открывать горячую воду то ее небыло (горелка не зажигалась)
Проблема была в плате. Замена решила проблему.